Молекулы белков лежат в основе почти всех биологических процессов. Ученым всегда были любопытны как белки, участвующие в метаболических путях, так и молекулярные основы их функционирования. Однако в эру системной биологии еще больше внимание уделяется полному пониманию работы всей совокупности белков организма, его протеома. Все более важно, что мы не только понимаем все стороны данной функции, или функций, какого-либо белка, но и то, что наше знание распространяется на все компоненты изучаемой системы или организма и так далеко, насколько это возможно. Без всестороннего анализа информации попытки синтеза и расчетов не смогут выйти за рамки приближенной реальности.
Книга "Структура и функционирование белков: Применение методов биоинформатики" представляет собой уникальный обзор современного состояния вопросов моделирования структуры белков и предсказания их функции. Книга написана ведущими специалистами в своей области, прекрасно иллюстрирована и содержит ссылки на доступные серверы и другие ресурсы, которые читатель, возможно, захочет использовать в своей научной работе. В конце каждой главы описываются перспективы развития и наиболее актуальные проблемы соответствующих областей науки.
На сегодняшний день научное сообщество довольно близко подошло к объяснению явлений, природа которых до недавних пор была не ясна, --- таких как обмен доменов, круговая перестановка, образование фибрилл, белки с присущей неупорядоченностью и многими другими. В 2008 году мы сталкиваемся с метаморфными белками, исследование которых может значительно поспособствовать нашему пониманию пространства типов укладки белков. И несмотря на то, что структуры белков непрерывно готовят нам новые трудности, совершенно ясно, что биоинформатика структуры и функции белков на протяжении многих лет будет оставаться одной из самых востребованных и волнующих областей исследований.
Книга рассчитана на студентов, аспирантов и специалистов, интресующихся вопросами молекулярного моделирования и биоинформатики.
Molekuly belkov lezhat v osnove pochti vsekh biologicheskikh protsessov. Uchenym vsegda byli lyubopytny kak belki, uchastvuyushchie v metabolicheskikh putyakh, tak i molekulyarnye osnovy ikh funktsionirovaniya. Odnako v eru sistemnoy biologii eshche bolshe vnimanie udelyaetsya polnomu ponimaniyu raboty vsey sovokupnosti belkov organizma, ego proteoma. Vse bolee vazhno, chto my ne tolko ponimaem vse storony dannoy funktsii, ili funktsiy, kakogo-libo belka, no i to, chto nashe znanie rasprostranyaetsya na vse komponenty izuchaemoy sistemy ili organizma i tak daleko, naskolko eto vozmozhno. Bez vsestoronnego analiza informatsii popytki sinteza i raschetov ne smogut vyyti za ramki priblizhennoy realnosti. Kniga "Struktura i funktsionirovanie belkov: Primenenie metodov bioinformatiki" predstavlyaet soboy unikalnyy obzor sovremennogo sostoyaniya voprosov modelirovaniya struktury belkov i predskazaniya ikh funktsii. Kniga napisana vedushchimi spetsialistami v svoey oblasti, prekrasno illyustrirovana i soderzhit ssylki na dostupnye servery i drugie resursy, kotorye chitatel, vozmozhno, zakhochet ispolzovat v svoey nauchnoy rabote. V kontse kazhdoy glavy opisyvayutsya perspektivy razvitiya i naibolee aktualnye problemy sootvetstvuyushchikh oblastey nauki. Na segodnyashniy den nauchnoe soobshchestvo dovolno blizko podoshlo k obyasneniyu yavleniy, priroda kotorykh do nedavnikh por byla ne yasna, --- takikh kak obmen domenov, krugovaya perestanovka, obrazovanie fibrill, belki s prisushchey neuporyadochennostyu i mnogimi drugimi. V 2008 godu my stalkivaemsya s metamorfnymi belkami, issledovanie kotorykh mozhet znachitelno posposobstvovat nashemu ponimaniyu prostranstva tipov ukladki belkov. I nesmotrya na to, chto struktury belkov nepreryvno gotovyat nam novye trudnosti, sovershenno yasno, chto bioinformatika struktury i funktsii belkov na protyazhenii mnogikh let budet ostavatsya odnoy iz samykh vostrebovannykh i volnuyushchikh oblastey issledovaniy. Kniga rasschitana na studentov, aspirantov i spetsialistov, intresuyushchikhsya voprosami molekulyarnogo modelirovaniya i bioinformatiki.
Protein molecules are the basis of almost all biological processes. Scientists have always been curious as proteins involved in metabolic pathways and the molecular basis of their functioning. However, in the era of systems biology, more attention is paid to a full understanding of the work of the entire set of proteins of an organism, its proteome. All the more important that we not only understand all sides of this function, or functions, of any protein, but that our knowledge extends to all components of the system under study or of the body and as far as possible. Without a comprehensive analysis of information, attempts of synthesis and will not be able to go beyond approximate reality.
The book "Structure and function of proteins: Application of bioinformatics methods" is a unique overview of the current state of modeling of structures of proteins and predicting their functions. The book is written by leading experts in their field, beautifully illustrated and contains links to available servers and other resources that the reader might want to use in their research. At the end of each Chapter describes the prospects of development and the most urgent problems of respective fields of science.
To date, the scientific community came quite close to the explanation of phenomena, the nature of which until recently were not clear, --- such as exchange domain, circular permutation, the formation of fibrils, proteins with inherent disorder, and many others. In 2008, we are faced with metamorphic proteins, the study of which can significantly contribute to our understanding of space types of protein packing. And despite the fact that the protein structure continuously making us new challenges, it is clear that bioinformatics structure and function of proteins for many years will remain one of the most popular and exciting fields of research.
The book is intended for graduate students and professionals interesuyuschihsya issues of molecular modeling and bioinformatics.
